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微生物菌株鉴定服务

 1、微生物菌株鉴定服务详细内容

微生物因为体积小、质量轻、适应性强、繁殖能力强等特点,广泛分布于自然界中。通过DNA测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速,准确。华美瑞康凭借多年的微生物检测经验为您可提供快速、、权威的微生物检测服务,包括细菌16srDNA鉴定和真菌18srDNA鉴定/真菌ITS鉴定。

2、细菌16srDNA鉴定

16S rDNA是编码原核生物核糖体小亚基rRNA 16S rRNA)的DNA序列,长度约为1540bp,存在于所有细菌染色体基因组中。16S rDNA分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中常用、有用的“分子钟”。其序列包含910个可变区(variable region)和11个恒定区(constant region)。保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系,而高变序列区域则能体现物种间的差异。16S rDNA分子的序列特征为不同分类级别的近缘种系统分类奠定了分子生物学基础。近几年来,国内外学者采用不同的分子生物学方法对各种细菌的16S rDNA进行了广泛的研究,获得了大量的16S rDNA序列信息,并集中于NCBI数据库中。将测序得到的16S rDNA序列在NCBI上进行Blast比对,即可获知与该序列同源性较高的已知序列,为确定菌种的分类学地位提供依据。

3、送样要求

1)、若提供平板、甘油菌或穿刺菌,请注明培养条件,菌种培养需特殊培养基的请提供培养基;请确保您提供的平板或斜面上的单菌落经过至少三次的分离纯化。因实验样品不纯造成的测序套峰,我们将收取全额的实验费用。

2)、若提供基因组DNA样品,请确保其浓度≥10ng/μl,总体积≥50μl,样品定量检测结果将以我们为准。

3)、若提供的菌株为革兰氏阳性菌,建议您提供基因组DNA

4)、若提供的为培养后的菌液,请确保包装的密封性和菌液的浓度,使终离心后菌体质量不低于0.5g

5)、我们不接受具有致病性的样品。如果您的菌株带有致病性,请提供该菌株的基因组DNA,并对其进行处理以灭活致病菌。

4、提供结果

1)、进行引物设计合成;

2)、 PCR扩增18S rDNA/ITS

3)、PCR产物纯化;

 

4)、测序,序列比对分析。

5 序列文件

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